[MySQL] - Verificando tabelas InnoDB fragmentadas e reorganizando os dados

O que são tabelas fragmentadas?

Se houver inserções aleatórias em ou exclusões dos índices de uma tabela, os índices podem se tornar fragmentados.
A fragmentação significa que a ordem física das páginas de índice no disco não está próxima a ordem do índice dos registros nas páginas ou que há muitas páginas sem uso no bloco de 64 páginas que foram alocados para o índice.
Os sintomas de tabelas fragmentadas pode ser que a tabela pode ter mais espaço em disco do que o necessário ou os resultados pode retornar mais lento, com mais de disco I/O do que o necessário. Usuários INNODB precisa verificar a fragmentação muitas vezes, porque quando as marcas INNODB dados como excluído, ele nunca substitui os blocos com novos dados. Ele só os marca como inutilizável. Como resultado, o tamanho dos dados é artificialmente e recuperação de dados é retardado.

SELECT 
TABLE_SCHEMA, TABLE_NAME, CONCAT(ROUND(data_length / ( 1024 * 1024 ), 2), 'MB') DATA, 
CONCAT(ROUND(data_free  / ( 1024 * 1024 ), 2), 'MB')FREE 
              from information_schema.TABLES 
          where TABLE_SCHEMA 
       NOT IN ('information_schema','mysql') and Data_free < 0;

Agora crie uma rotina de executar o script abaixo.

 #!/bin/bash
 
MYSQL_LOGIN='-u<user name> --password=<passowrd>'
 
for db in $(echo "SHOW DATABASES;" | mysql $MYSQL_LOGIN | grep -v -e "Database" -e "information_schema")
do
        TABLES=$(echo "USE $db; SHOW TABLES;" | mysql $MYSQL_LOGIN |  grep -v Tables_in_)
        echo "Switching to database $db"
        for table in $TABLES
        do
                echo -n " * Optimizing table $table ... "
                echo "USE $db; OPTIMIZE TABLE $table" | mysql $MYSQL_LOGIN >/dev/null
                echo "done."
        done
done
 

É importante lembrar que quando de-fragmentam uma tabela, o processo irá bloquear a tabela, por isso certifique-se de que você pode fazer esse bloqueio.

Fonte: http://www.aodba.com/pt/blog/2015/02/19/verifique-se-ha-fragmentacao-em-mysql-e-corrigi-lo/